合宿免許では、仮免許三回落ちたら、一回自分の住んでるところに帰って、免許セ

合宿免許では、仮免許三回落ちたら、一回自分の住んでるところに帰って、免許センターで受けるらしいんですが、通学で通う自動車学校は、仮免許何回でも受けられるんですか？

さあ、自動車学校ごとに異なるので、何とも言えません。通学なら何回でも受けられると思いますよ。（当然ですが受験料はその都度かかる）
自動車学校の検定に落ちるような技量の人が、試験場で受かるとはにわかには思えませんけど…

教習所によって運用が異なります。
仮免許学科試験に合格しないことには第2段階へ進むことができず、それまで教習がストップしてしまうため宿泊施設に余裕がないところでは学科試験のためだけに部屋を潰されるというのを嫌うようです。
この場合、交通費自己負担で地元へ帰った後、自分で必要な勉強をした後運転免許試験場で学科試験を受験（受験料自己負担）する流れとなります。一時帰宅時に修了検定合格証明書を渡されるためそれを提示すれば技能試験は免除されます。修了検定合格証明書の有効期間は3ヶ月で、それまでに合格できない場合はすべて無効になる恐れがあります。
また、この場合宿舎に余裕がないことがほとんどであることからいざ学科試験に合格しても教習再開までしばらく待たされると言うこともあります。
合宿教習ではそのような滞留が起こらないように修了検定の受験資格として仮免前効果測定に複数回合格することを求めていることがあります。
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宿舎に余裕がある場合はそのまま滞在となり（相部屋・雑魚寝部屋に移動となることもあります）、効果測定を受けたりコンピューター学習システムなどにより徹底的に対策をすることになります。当然延泊分の宿泊費用や学科試験受験料はその都度必要です。財布へのダメージは結構大きいですから、学科教習は真剣に受けてください。
通学制の場合は学科試験受験料を納めることで特に制限なく受けられることがほとんどですが、学科試験に何度も落ちたことは教習原簿に記録されることから指導員にも分かるため第2段階での指導で肩身が狭い思いをするかもしれません。

修了検定合格の有効期間は3ヶ月ですから、有効期間内であれば、何回でも仮免学科試験を受けることはできます。
合宿免許の場合はできるだけ短い期間で卒業するというのが目的ですから、1回で合格ができなければ、教習所の実施予定に合わせて短い周期で2回目の試験を受けなければなりません。
2回目、3回目と受けても合格できない場合、十分な勉強時間が取れない為に、これ以上試験を受けたところで合格できる可能性は低いですから、一時帰宅をして時間の制約を受けずにしっかり勉強をして、地元の運転免許試験場で仮免学科試験に合格して再合流をしてくださいということです。
合格できるまで何回でも試験を受けさせた場合、合格できない人は学科試験だけの為の延泊がどんどん増えてしまい、教習生にとっては金銭的な負担となり、学校側にとっても長期滞在者が増えてしまい、よいことは何もありません。
また、3回目不合格で一時帰宅という規定を設けておくことで、教習生が授業をしっかり聞いて、復習をして試験に備えるようになるという効果もあるでしょうね。
通学の場合は、教習生が何回試験を受けようと、教室の中の一人の受験者に過ぎませんから、そのような規定は必要ありません。

合宿免許で仮免に合格できない人が、
免許センターで合格できるのかと。。。

つまり、匙を投げられたってことでしょうね。
二度と来るなと。

法的な回数制限はありませんが、合宿の場合は宿泊費用の都合で、上限回数を超えたら一度帰されるプランになっている事が多いようです。

法律上は、３回という制約はなし。
合宿免許では、というより、回数を設定している所自体に珍しさがあります。
合宿でも、何度も受けられるとこは多いはず。