免許証を持っている人がマイナンバーカードを申請しようとすると

免許証を持っている人が マイナンバーカードを申請しようとすると
身分証として免許証の方が優れているのに 馬鹿じゃないのか？
と言われるのですか？

普通はそうですね。
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q14188835104
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q13190066453
なお e-taxのセキュリティは保証されておらず
マイナンバーカードの危険や身分証としての不便さを補う材料にはなりえません

馬鹿は余計なお世話だと思うよ
税申告など
電子の場合は
マイナンバーカード必要です
ない人は
郵送か窓口提出です