普通自動2輪免許を今所持しています。もしも更新日から半年以内に気づい

普通自動2輪免許を今所持しています。もしも更新日から半年以内に気づいた場合普通免許と同様に手数料等を払えば帰ってきますか？

いわゆる「うっかり失効」ということでしょうか。
その場合は、失効後半年以内であれば、どの種類の運転免許を所持していても同じ手続きです。
厳密には「返ってくる」という表現は違います。
失効してしまえば無免許です。しかし、つい先日まで問題なく免許を所持していた人に、一からやり直せというのはあまりに無慈悲なので、試験を受ける際に学科試験と技能試験を免除しましょうという制度です。
ですから、手続きとしてはあくまで運転免許試験です。
そのため、試験場で平日のみの受付となりますし、本籍記載の住民票の写しも必要になります。

失効させてしまったら免許は帰ってはこんよ。
半年以内なら受験料と更新者講習費用を払っての「失効再取得」ということで、あくまでも「新たに取り直し」という形です。
もしも、複数の免許を持っていた場合で、それら免許をすべて「再取得」するとなると、すべての免種の「受験料」が必要になってくるので、高くつくよ。