回答お願いします。 - 僕は原付の免許を既に持っており、初心者期

回答お願いします。
僕は原付の免許を既に持っており、初心者期間は終了しているのですが終了してから一時不停止とスピード違反で現在違反点数が3点です。
そして先日、普通車の卒業検定が終了し、後は免許センターへ行くだけなのですが、違反点数3点でも試験に合格すれば免許証が交付されるのでしょうか？それとも交付されてすぐ初心者講習の案内がくる、または交付されないということなどがあるのでしょうか。
せっかく卒検までいったのに水の泡になってしまうのではないかと心配です。
お手数ですがご回答お願いします！補足補足です。
もし3点のまま発行されるとなれば、そこから3点の違反があれば免停講習又は免停、それとも初心者講習、あるいは両者となるのでしょうか

初心運転者制度は免許の種類ごとになりますので
原付の点数は普通自動車の初心運転者制度の点数には含まれません（取得前、取得後どちらも）
行政処分に係る点数制度は免許の種類によらず合計点で計算されますので、既に3点ある状態になります。したがってあと3点で免停となります
同時にその違反が自動車での場合は初心者講習になります

免停などの、行政処分に
なって居なければ
マイナス３点状態で、
普通免許が発行されます。