先程教習所から第一段階の実習が残っているから来い、との電話がありました。

先程教習所から第一段階の実習が残っているから来い、との電話がありました。
しかし、私は先日仮免許をすでに取得しました。
仮免許は第一段階の実習と学科全て終わっていなくても取れるのですか？

その仮免許がその教習所で受験して得たものであるなら、修了検定まで終えていないと不可能ですので、先方の記録に誤りがあるのでしょう。既に一段階は終えて仮免許を持っているので、何かの間違いだ、と返答すればいいと思います。
その仮免許が一般試験を受けて勝手に取ったものであれば、教習コースから逸脱した状態になります。その場合に、一旦中途解約をして二段階からの入所に契約変更をしなければいけないのか、それとも一段階の教習を全てする代わりに修了検定と仮免許試験なしで二段階に進めるようにするかは、教習所の判断ですね。

無理？じゃないか。、、、。

仮免許は第1段階を終えて仮免許試験に合格しないと付与されません。

あちらの間違いでしょう。
でも、こんな電話が来たのですが、私は昨日仮免取りましたし、
手帳にも判子がありますが、、、と言ってみたら？
確認はしておいた方がいいのでは？