質問です。 - 普通自動車免許ATを所持し、中型バイク免許を取る際は学科免除と

質問です。
普通自動車免許ATを所持し、中型バイク免許を取る際は学科免除と聞くのですか、教習所で卒検合格したら免許取得できるのですか？

卒業したら免許センターて手続きと講習をうけて（話聞くだけ）免許発行。
試験とかはない。

公認の教習所、ならね。

私は普通免許取得後に当時の中型二輪教習に通いましたが
教習所の卒業証明書を免許センターへ持参し
視力検査などの適性試験を受けて新しい免許証を貰いました。
免許センターでは学科試験はありませんでした。
その後 試験場のコースをナナハンで走って
大型二輪免許を取得した時は、免許の裏面に
スタンプを捺されただけでした。
今は普通二輪と大型二輪の免許が別々になったので
免許証も新しくなりますね。

卒業証明書が発行されるから、その後運転免許試験場にそれを携えて適性試験(視力)を受け、普通免許を書き足して(運転免許を新しくして)もらう手続きは必要です。

車両にも免許にも、バイクに中型はありません。
普通自動車免許の所持者であれば、普通/大型自動二輪免許の受験時の学科試験は免除です。
教習所は民間企業で、免許証を発行する権限はありません。指定教習所を卒業して得られるのは、本免許技能試験の免除の特典だけです。運転免許は、試験場で試験を受け、合格しないと取得できません。
学科試験免除の人が、指定教習所を卒業して技能試験免除になっても、まだ適性試験がありますので、試験場で試験を受け、合格する必要があります。交付手続きはその後です。ただし、指定教習所を卒業できる人なら適性試験に不合格になることはまず無いので、卒業できるなら合格できるでしょう。