AT限定免許は就職で不利ですか？ - 不利になります。

AT限定免許は就職で不利ですか？

不利になります。

不利になることはあります。
有利になることは絶対ありません。

上場企業とか公務員とかなら全く必要無い。っていうか免許すらいらない。
ただ、再就職とか中小企業だと不利。ハローワークに行くと「AT限定不可」というのが結構目に付くよ。

弊社にMT車はありませんので問題ないです。

募集要項にＭＴに乗れる人材が欲しいのなら、最初から準中型免許か中型免許が必要と記載します。
必要がないから記載していないのです。
必要な資格が募集要項に記載されず、面接などのときにそれを伝えるような会社は、キチンとした対応が出来ない会社としか言えませんから避けた方が無難です。

今時「仕事でMT車を使うからAT限定は不可」なんて職場にロクなところはありませんから、AT限定で不利になるような就職先は無視するのが適切ですよ。運送業や建設業なら準中型自動車免許が居るでしょうしね。
それに、運転免許の有無や内容で就職の有利不利が決まると言うのは、逆に言えばそれくらいしか自己アピールの手段がない人材だと言う事です。世の中、運転をしなくてもいい仕事は沢山ありますが、それらの仕事には相応の資格や経験が求められます。でも、そういうのを全く持たず、相手にして貰えない人材だから、運転免許が云々と言わなきゃいけなくなるんですよ。就職に不利なのはその点であって、免許の限定条件なんてのは些細な話に過ぎません。