自動車免許の修了検定で9:00〜16:00までかかるそうですが、

自動車免許の修了検定で9:00〜16:00までかかるそうですが、どうしてそんなに時間がかかるのでしょうか。内容は実技のほかに筆記もあるのですか

修了検定なら、仮免許の学科試験もあるでしょう。
それに採点や仮免許の手続きなどを考慮したら、時間がかかるのが普通です。

自動車学校によって多少違いはあるでしょうが、私の通っていた自動車学校は3人1組で実技を順番に行なっていたので待ち時間がありました。
その後、午後から簡単な視力検査や仮免許のペーパーテストでまあまあ時間がかかります。

他の人もいますし、ひたすら待たされます

あなた一人だけにやってるわけでも無いでしょう。