普通免許を取ってから普通二輪免許を取るのとその逆では値段は変わります

普通免許を取ってから普通二輪免許を取るのとその逆では値段は変わりますか？またどっちがおすすめですか？

一度、質問者さんの最寄りの教習所の料金表で試算してみましょう。どちらを先にとっても、時間も料金も殆ど違わない事に気づくと思いますよ。先に自動二輪を取得すると、後で受ける普通自動車の学科試験は免除になりますが、合計の教習時間は1時間長くなります。でも、相違点はその程度ですからね。
なので、地元の教習所に通うのであれば、正直どちらでも構いません。教習時間が長い普通自動車を先にした方が心理的な負担が軽くなるでしょうし、満16歳から取得できる普通二輪を先にした方が、誕生日が遅いなどで普通自動車の教習にかけられる期間が限られる人には有利かも知れません。個々の事情でどちらがいいかを判断すればいいでしょう。
ただし、合宿コースを利用して取得する気でいるなら、先に普通自動車を合宿にし、普通二輪は後で地元の通いにする事をお薦めします。
合宿コースに参加する場合、朝から夜まで教習漬けになりますが、技能教習には1日当たり2～3時間までしか受けられない、と言う法律の制限があります。通常は、学科教習をその隙間に散らして時間を効率的に使用できますが、後で取得する方も合宿にすると、散らすべき学科教習が無いので、毎日暇を持て余してしまいます。空き時間ができたからと言って、合宿の参加中は、自由な外出や宿舎への移動ができないのが普通ですからね。
なので、先を合宿にし、後は地元通いにするのが合理的です。この時、後を二輪にしておけば教習時間が短くて済むので、通う期間と負担を軽減できます。