菅内閣で免許証のデジタル化を推進してますがスマホの中に免許証が入るのですか？

菅内閣で 免許証のデジタル化を推進してますが スマホの中に免許証が入るのですか？ 将来的には免許証は廃止になるのですか？

いいえ。運転免許の所持を確認する方法が、実体免許証によらないデジタルな方法で実現される、と言う意味ですよ。株券は電子化により証券自体が無くなりましたが、運転免許は実体免許証が廃止になる事は無く、ただ「発行しない」ことが主流になるだけだと思います。
免許証がスマホや、マイナンバーカード等の共通IDカードの中に入るのではなく、スマホやIDカードで行う本人確認に成功すれば、現在の免許証情報がオンラインでチェック可能になり、それが実体免許証の提示に代わる所持証明になる、と言う事でしょうね。そして、スマホや共通IDカード類が所持必須にならない限り、運転免許証も実体として残るでしょう。