会社から中型の免許を取りに行くよう言われたので近いうち自動車学校に行くの

会社から中型の免許を取りに行くよう言われたので近いうち自動車学校に行くのですが、もし補習や再試験などによる追加金が発生した場合、自分で払えば会社にはバレないですか？
入校の際のお金は会社が支払います。（多分振り込み）

会社にもよると思いますが、
補習や延長は個人負担というのが多いと思います。
先に会社に確認。
個人負担なら堂々と補習を。

まず隠そうと言う事が不味い。
会社の指示により免許を取りに行くのは「業務」にもなり、仮に追加で乗らなければならない、1発合格とならず再試験を受けなければならず平日昼間(勤務時間中)に行かなければならない、となった場合に免許取得以外の仕事をどの様にするつもりですか？
物事の失敗を隠すと言う事は、普段の仕事から失敗を隠そうとしたり隠す事でもあり、上手く見つからない失敗や誤魔化せる失敗なら上手く行っても、補講や再試験は隠しようの無い事にもなりますよね？
仕事をする上で必要なのは報告･連絡･相談の「ホウレンソウ」が重要。
会社側からしても免許取得に向けては「失敗」にはならない部分ですが、免許取得し免許の範囲で仕事として運転しなければならないですし、仕事で運転する以上は会社の看板を背負って運転すると言うこと。
運転中に接触し車に傷を付けるだけでも隠せない場合もあれば、隠したつもりでも目撃者から会社に報告されれば隠せませんよね。
「隠す」事が習慣化するのは不味いこと。
素直に報告して先の判断を仰ぐのは当然であり必要な事では。

バレたくないなら、事務員さんに言えば配慮してくれるでしょう。

会社は経費。
申告するから教習所から全ての費用詳細は当然把握するでしょw