大型二種免許を免許センターで直接試験受けて取得した人も、長野県

大型二種免許を免許センターで直接試験受けて取得した人も、長野県の自動車学校の合宿免許で取得した人も、どちらの方法で大型二種免許を取得したとか関係なく、業務中に問題起こすと本社に呼び出され生き恥さらすこ
とになるのは全国のバス会社共通事項ですか？

問題のレベルによりますが、営業所処理の苦情や物損事故くらいじゃ呼び出されませんけどねぇ……
懲戒処分を伴うようなものなら呼び出されますが

会社に就職した以上は、
その会社の内部規定に則して指示命令がきますので、
免許を取得した手法には関係ありません。
全国のバス会社が、統一の規定があるわけではありません。
そのバス会社の個々の判断です。

そりゃそうだわな。
人を扱う仕事ってそういうもん。
バスに限らず。

大きな問題を起こせば呼び出しでしょうね、チョットしたことだと運行管理責任者にお説教をくらい、始末書（原因、自己分析、今後の改善方針）を書いて処分（乗務停止等）を受けて終わり。会社によって異なるよ。