原付二種や普通二輪免許は普通自動車免許を持っていると取得が早

原付二種や普通二輪免許は普通自動車免許を持っていると取得が早くなると聞きますが、これらは普通自動車免許のAT限定でも同じなのでしょうか？

普通二輪免許・大型二輪免許・普通免許・準中型免許・中型免許・大型免許・
大型特殊免許・牽引免許の第一種免許の学科試験は共通なため、
何れか1つの免許を取得していれば、他の免許の学科試験は免除です。
その分時短になります。
原付二種は、普通自輪に含まれます。
普通免許取得に当たって、仮免学科試験も免除です。
従って、免許センターでは、教習所を卒業していれば技能試験も免除で
残る試験は、適性検査のみです。
尚、学科教習は、2コマ(危険予知・高速)あります。

ええ。普通自動車免許にどんな技能の限定条件がついているかは関係ありません。