田舎の農家生まれの高校生です。免許を取ろうと思っています。マニュアル

田舎の農家生まれの高校生です。免許を取ろうと思っています。マニュアル車って運転できた方がいいですかね？
家の車は全てオートマ車なのでいらないと思ったのですがどうですか？

免許は資格なので、
必要な資格を必要な人が取得するだけと思います。
なので、
・将来ＭＴ車を運転したい、運転する必要があるなら
限定無しの免許が必要
・将来ＡＴ車しか運転しないのであればＡＴ限定免許でＯＫ
ということになります。
なので、冷たい回答かもですが、
質問者さんの事を何も知らない第3者に
ご質問をされても回答は誰もできません。
ちなみに今限定無しの免許を取る人の
パターンは大体以下になると思います。
①特に意味もなく男だからＭＴと考えて人
→ほとんどは卒業後もＭＴは運転せず、
１～２年でＡＴ限定者と同じになる
②ＭＴ車の運転をしたい車や機械に興味がある人
③将来の仕事や職業においてＭＴ車の運転資格が
必要か、そうなる可能性がある人
私は年齢的にＡＴ限定免許制度が無い時代なので、
選択肢はありませんでした。
なので私の時代は女性も全員が限定なしで
免許を取得しています。
ちなみにもし私がＡＴ限定免許制度がある時代に
免許を取得する場合でもＡＴ限定免許はとりません。
理由は上記の②で、
私ヤクルマや車の運転が好きであり、
モータースポーツを趣味とするからです。
なので、今まで購入した約20台以上の
車はすべてＭＴ車のスポーツカーです。

後を継ぐつもりはあるのですか？
継ぐつもりはない、手伝うことはあるという程度なら、AT限定で問題ないと思います。
後を継いで農家をするつもりなら、いくら自分のところの軽トラがオートマでも、農家同士で助け合ったりして、よその軽トラを運転する可能性もゼロではないので、MTで取得しておいたほうがいいと思いますよ。
ちょっと動かしてと言われて、AT限定なので運転できませんというのはあまり格好良くないんじゃないかな？
必要かどうか、MT車を運転する機会があるかどうか、親に相談をしてみればどうですか？
女性でしたら、AT限定で問題ないと思います。

必要ありません。
と云うか欠陥構造で低性能なMTなんてメーカーが、造りたがらないのでほとんど買えませんよ(笑)
それに普通免許を持っていても、ヒール＆トー・ダブルクラッチすら出来ないドライバーばかりですから、まともに操作出来る人は、ほとんど居ません。

以前は運動神経０の女子高生だってマニュアルで教習したのに、それを嫌がる理由ってなに？

実用的には必要ないですが、運転できたほうが面白いです。

いらないですよ。
もし軽トラなどのマニュアルに乗る可能性があるなら別ですが、今の時代はほぼオートマですから。