免許を取るときに学割を使ったら高校にバレるのでしょうか？

免許を取るときに学割を使ったら高校にバレるのでしょうか？

はい、バレてしまいます

その「学割」のシステム次第ですね。鉄道会社などでは、学割の適用には、学校が発行する学割申請用の証明書が必要ですので、教習所が同様に証明書の提出を求めるなら、学校には当然にバレてしまいます。しかし、教習所が単なる客寄せ手段として、学生証等の提示だけで学割を適用してくれるのであれば、いちいち学校に連絡するようなことは無いので、それだけでバレはしないでしょう。
まあ、隠そうとしても、大抵はバレてしまうものですよ。