普通二輪車の免許を持っている状態で普通自動車を取りに行く場合は、ま

普通二輪車の免許を持っている状態で普通自動車を取りに行く場合は、また応急処置の学科をしないといけないのでしょうか？

いいえ。
既に普通・準中型自動車免許がある人が自動二輪を受験する場合、あるいは既に自動二輪免許がある人が普通・準中型自動車を受験する場合、法定の「応急救護処置講習」の受講が免除されます。よって、指定教習所の教習コースを利用する場合でも、応急救護の学科は課されません。そもそもが学科試験免除なので他の学科教習もなく、行われるのは危険予測関連の座学が1～2時間のみです。

普通二輪車の免許を持っている状態で普通自動車を取りに行く場合は、
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普通二輪免許持ちの普免学科教習は、
高速と危険予知の2コマです。
既知だと思いますが学科試験は、
仮免含め本免も免除ですから。

いいえ。