40歳で免許を更新するのを(体に障害が出来ましたので)辞めようと思っ

40歳で免許を更新するのを(体に障害が出来ましたので)辞めようと思ってるのですが、返納の手続きをした方が何かメリットはありますか?
無かったら、そのまま期限までに行かなければ良いんですかね?

ええ。それでいいですよ。
返納するか、失効から5年以内に申請すれば、運転免許証「もどき」である「運転経歴証明書」が取得でき、本人確認書類代わりに使えます。ただ、それに付随する特典は、たいていが高齢者限定で、しかも内容は正直しみったれています。40歳で返納した人には、ほぼ特典は無いでしょう。であれば、本人確認書類として使う必要が無いなら、わざわざ費用をかけて申請する必要はありません。