普通車の免許を取った後に二輪の免許を取りに教習所へ行く場合、学科は免除さ

普通車の免許を取った後に二輪の免許を取りに教習所へ行く場合、学科は免除されますか？

はい、学科試験は免除となる関係で学科教習も大幅免除となります。(試験に関係ない1時間、危険予測と二輪車の特性および2人乗りの基礎知識だけ技能とセットで学びます。)
実質的に技能教習みたいなもんですが学科教習にカウントされます。

1時間だけ受講が必要です
ちなみに、免許センターでの学科試験は免除です

原付除けば学科は共通ですので省かれます。

セット教習の１時間は受ける必要が有です。
それ以外の学科教習と、学科試験は免除です。

学科教習は2時限だけある。
学科試験は免除です。

されます。
学科は一種免許だったら全ては共通です。普通自動車免許を持っているなら大型自動車免許だろうが学科は共通なので免除です。
学科が発生するのは、タクシーやバスを旅客運送できる二種免許を取得しようとすれば、二種の学科試験を受ける必要がでてきます。