普通自動二輪免許を取る場合 - 普通車免許を保有していて、学科試験が免除な

普通自動二輪免許を取る場合
普通車免許を保有していて、学科試験が免除なのは知っているのですが、この場合教習所を卒業して免許センターでは学科試験を行うのですか？

いやいや、学科試験が免除と書いているのに、センターで学科試験をするのか？、と言う質問をするのは、自己矛盾でしょ。そもそも、自動二輪免許には仮免許試験は無いのですから、教習所で学科試験は受けません。あっても模擬試験だけです。
センター(運転免許試験場)で学科試験を受けなくていいから「学科試験免除」なんです。よって、教習所でも模擬試験をする必要も、そのための学科教習を受ける必要もなくなります。ただし実際には、危険予測ディスカッションの1時間だけ学科教習があります。