再交付申請には申請用写真が必要なので、証明写真を準備して持参する必要があります。ただし、それはあくまで申請用であり、再交付される免許証に印刷される写真は、申請窓口でデジタルカメラで撮影したものが使われます。再交付申請の場合に、免許証写真に持ち込み写真が使えるかどうかは都道府県で異なりますが、多くの都道府県では使えないようですね。
写真のサイズは新規申請をした時と同じで、3cm x 2.4cm です。無人の証明写真機だと 3cm x 2.5cm の印刷モードがあるでしょうから、それでプリントし、左右を0.5mmずつ切り詰めればいいでしょう。