運転免許の住所が旧住所のまま3年以上過ごしてしまいました。明日、警察署か免

運転免許の住所が旧住所のまま3年以上過ごしてしまいました。
明日、警察署か免許センターへ行って住所変更を行います。
運転免許証の住所変更は「速やかに」行うことが原則とされています。
警察署や運転免許センターで住所変更を行う際、相手にはどうやって「いつ引っ越してきたか」判明するのでしょうか？こちらの申告制でしょうか？向こうで何かのデータを参照されるのでしょうか？
3年以上更新しなかったことを向こうが把握し、厳重注意や罰金などに発展するのでしょうか？
お分かりになる方、いらっしゃったら教えてください。

現住所確認のためにもっていった書類にもよると思います。単に公的機関の請求書などであれば、いつ引っ越してきたか、という情報がありませんから、住所変更の時点では、分からないと思います。
何か重大な刑罰を犯していて、逃げているような場合は、公安委員会として動くことが考えられますが、そうでもなければ、特に問題視はされないと思います。
よほど悪質でもなければ、それをもって摘発されるまでは至らないと思いますので、気づいた今から「速やかに」変更しに行ってください。