私は指定教習所ではなく認定教習所というところで教習を受けているため、技

私は指定教習所ではなく認定教習所というところで教習を受けているため、技能も含め全ての試験を警視庁での運転免許センターで受けています。
仮免許学科→仮免許技能→本免学科→本免技能という順番で試験を受けています。
本免の学科も合格し、最後に本免の技能を受けて受かれば免許取得できたのですが、試験に合格できなかったため仮免許の期限が切れてしまいました。
その場合の試験は最初(仮免許学科)からやり直しなのでしょうか？？？

仮免学科試験の合格証明と仮免許証の有効期限は6ヶ月ですから
また仮免学科試験から受ける事になります。
余談。本免技能試験は本免学科試験合格の有効期限内なら
何度も受けることが出来ます。
質問者さんの場合は本免学科試験合格の有効期限内に本免技能試験が
合格出来なかったと言う事でしょうか？

仮免の学科からやり直しですね。
仮免の有効期限は6ヶ月あったはずですが、
次回はサッサと本免試験受けた方が良いですね。

その通りです

＞＞その場合の試験は最初(仮免許学科)からやり直しなのでしょうか？？？
↑↑↑
お考えの通りです。