いま小型特殊免許を持っているのですが、今後普通免許を取るつもりです

いま小型特殊免許を持っているのですが、今後普通免許を取るつもりです。普通免許には小型特殊も乗れるため、この場合、小型特殊免許はどうすればいいのでしょうか？

何もされる必要ありません。
普通免許追加の手続きの際に、
今の免許提出します。
手続き終わると普通免許追加され、
新たな有効期間が設定された新免許が
交付され、提出したそれまでの免許は
返却されません。

そのままで構いません。免許には小特の記載は残ります。普通取る前に原付も取るとその後フルビットにしたいときに有効ですw

何もしないでいいです。

どうもしなくて結構です。普通車の免許を取れば、免許証の種類の蘭に普通と小特と書かれる。だけです。