確かに、新車販売台数などをみても、圧倒的に AT 車が多いので、AT限定免許でも困らない、という場面は多いと思います。ただし、仕事で使う車となると、AT 車も増えてきていますが、MT 車もまだまだ生き残っている部分もありますので、まったく MT 車とかかわらないとも言い切れない部分もあります。
そういったことを考えると、制限のある AT 限定ではない免許を取得しておけば、つぶしがきく、ともいえますので、個人的には、どうせとるなら AT 限定なしをお勧めしますが、以前ほど絶対限定なしが良いというわけでもないので、その辺りは悩ましいところです。
履歴書に所有資格として書くときは、普通自動車運転免許(AT限定)と書くことになるとは思います。