免許更新をした後に免許の本籍を変えていないことに気がつきました。

免許更新をした後に免許の本籍を変えていないことに気がつきました。10数年前に結婚した時に変えたつもりが変わっていませんでした。すぐに変更しますが、罰金ですか？

なんもないと思いますよ。
本籍入りの住民票を持って申請することになると思いますが、いつ本籍を変更したかって警察はわからないですし。

法律的には2万円以下の罰金か科料に相当する違法状態です。が、指定暴力団員やカルト宗教構成員など、公安警察の監視対象者が微罪で検挙されるようなケースでないと、運転免許証の記載事項の変更の遅れで罰せられることはないですよ。まして、現在の運転免許証には、表面の本籍の記載は省かれていますし、本籍を変更しなかったからと言って何か不都合が起きることは無いですし…。