アメリカ人の友人が国際免許証を日本の免許証に更新する予定です。滞

アメリカ人の友人が国際免許証を日本の免許証に更新する予定です。滞在記録としてパスポートを提示したのですが、申請が通らなかったそうです。他に何か代わりに証明できる物はありますか？
補足皆さん、迅速に回答してくださりありがとうございます。
よくよく、本人に聞いたので補足します。
国際免許ではなく、一般的な免許証。
在日6年ほど。
窓口で聞いた所、はっきりアメリカにいた期間が書かれている書類が必要。例えば電気代の請求書とか。しかしそれだけでは足りない。色々持ってきて。と言われたそうです。

国際免許証「からの」日本の免許切り替えはできません。できるのは本国免許からの切り替えです。国際運転免許証(IDP)は、ただの翻訳証明書であって、運転免許証本体ではありません。ひょっとしてそれを理解せず、本国の免許証を持参しなかった、とかじゃないですか？。
きちんと本国免許と翻訳証明を提出しているにも関わらず、パスポートを利用しての申請が通らなかったのは、パスポートに米国の出入国印が無く、あるいは米国の運転免許に初取得日の記載がなく、免許の取得日以降に3か月間滞在したことが証明できなかったからでしょうね。そしておそらく、日本の出入国の時も自動化ゲートを通ってしまったので、日本の出入国記録からの推定もすることができなかったのでしょう。
この場合、米国の出入国記録を本国から取り寄せるしか方法はないと思います。日本の入管に日本の出入国記録を申請する方法もありますが、これが代用になるかどうかはちょっとわかりませんね。

アメリカで運転免許を取得後、通算して3ヶ月以上滞在していたことを証明する必要があります。
そのアメリカ人の方は、運転免許を取得された後、アメリカでどうされていたのですか？
大学に通っていました？働いていました？
在職証明、給与明細、学校の卒業証明書、成績証明など、最近はこのようなものが求められるようです。

アメリカの国際免許証は「AAA（JAFのような団体）」が発行しているものですから、受け付けて貰えません。
州発行の本物の免許証を提示する必要があります。
必要な書類は以下の通り。
https://www.keishicho.metro.tokyo.lg.jp/menkyo/menkyo/kokugai/kokugai05.html
https://jaf.or.jp/common/kuruma-qa/category-drive/subcategory-another-country/faq181
ただし、アメリカの場合、オハイオ州、オレゴン州、コロラド州、バージニア州、ハワイ州、メリーランド州及びワシントン州の免許証保持者は、ペーパー試験と技能試験の両方を免除されるので、そのまま書き換えが可能です。
インディアナ州の免許証保持者は、技能試験は免除ですが、ペーパー試験を受ける必要があります。
それ以外の州の免許保持者は、ペーパー試験と技能試験の両方が必要です。

短期滞在(90日以内)ならダメでは。その場合先ず在留許可取る。
国際免許は、international driving permit といってアメリカの州の運転免許を使う許可証でライセンスじゃないので、免許証にはならない。

自動ゲートを使用したのでパスポートでは出入国の確認が出来なかったとかではないでしょうか。その場合は出入国記録証明書などが必要になるようですが、申請した際にパスポートでダメと言われたなら、その時点で何が必要か確認すれば答えてくれたと思うのですが、確認しなかったのですか？

国際免許証じゃ無くて、アメリカ本国での運転免許証はないのですか？
発行年月日とパスポートの出国日で、免許を取得していた期間を証明できると思います。