免許合宿に行きたいのですが起立性調節障害で朝起きれません。朝は自分で起き

免許合宿に行きたいのですが起立性調節障害で朝起きれません。朝は自分で起きて授業に行かないと欠席（？）などになりますか？起こしてもらえたりしますか？
起きれるか不安です。

合宿免許では卒業までのスケジュールが組まれています。
朝、遅刻をして、1時限でも受けることができない授業が生じた場合、その授業を他の時間で受けることはできず、全体のスケジュールの組み直しが必要となり、延泊となります。
通学の教習所にも、短期間で卒業することができる、短期コースやスピードコースという名称のコースがあります。
悪いことは言いませんので、通学での免許取得をお勧めします。

もちろん欠席で、ギリギリに詰めたスケジュールが組まれているので、すぐに延泊になり追加料金が発生します。補習や不合格になっても追加料金を取らない、などと謳っているプランでも、教習生のミスによる遅刻欠席の場合は追加料金が取られるのが普通です。
また、教習所も、合宿先の宿泊施設も、滞在者の生活の面倒は見てくれません。大部屋の雑魚寝とかならともかく、わざわざ朝に起こしてくれたりもしません。「病人」の世話をしてくれる場所ではありませんからね。

国家資格を取ろうというのに、何を甘えたことを言っているのでしょうか？規則に従えない人に、資格を与えるわけもなく、部屋の時計で起床のアラームを慣らすくらいがせいぜいであり、起こしてもらえるなどということはあり得ないと思いますよ。
障害持ちであるから、一般の方と同じでは対応できない、ということであれば、免許の取得をあきらめるしかないと思います。

私の通ってるところでは講義は欠席しても大丈夫ですが実技を無断欠席したらお金払わされます
してしまう可能性があるならやめとくべきかと

朝自分で起きて授業に行けないと免許合宿に行っても免許はもらえません