車高調を付けるとダウン量分だけそののままサスストロークが減るんですか？

車高調を付けるとダウン量分だけそののままサスストロークが減るんですか？

ダウン量とは関係ないけど総じて車高調はストローク短い傾向があります。

現在3つの回答が付いていますが、2番目の方が「正解」です。
「車高を下げる」→「タイヤが上に動ける余地が減る」→「使えるストローク量が減る」
という仕組みです。
2番目の方が書いている通り、「サスの伸び側の余裕はむしろ増える」のですが、「縮んだ分以上に伸びる」と性能は逆に悪化しますから、良いことはありません。

全長式なら車高とストローク量は別々に調整できます。

大まかにいうと、車高を落とした分バンプストロークは確実に減ります。考えるまでもなく、当然ですよね？（一方リバウンドストロークは増えることになります。）
厳密にいうと、バンプラバーをどうするか？でフルバンプの位置は多少変えられますが、それでも車高を落としつつバンプストロークを維持しようとしても、タイヤが車体（ホイールアーチ内側）に当たるので、限界があります。
乗心地を悪化させたくない（＝バンプストロークを変えたくない）なら、シャコタンは選択肢には入りません。

全長式ならロアブラケットで調整すればストロークは減らないです