車高を限界まで下げるために、車体下部についている燃料タンクを、トランクなどに

車高を限界まで下げるために、車体下部についている燃料タンクを、トランクなどに移設するカスタムがありますが、あれって車検通るんですか？

添付画像の基準を満たし、車室内と鉄板で完全に隔離(トランクスルーのように後席が仕切りになっている物はダメ)されていれば車検に合格しますよ
公道走行車両ならFIA非公認の(自動車レースでは使えない)ガソリンタンクでも車検に合格します

そもそも、タンクの位置を変えないといけないくらい下げた時点で車検には通りません。

燃料タンクの移設は車検に通りますか？
公認を申請・合格すれば・車検に通ります

車両構造がメーカー届け出と変わるので通らないでしょうね。