免許証についてです。バイクで１年経たないうちに1度一時不停止で捕

免許証についてです。
バイクで１年経たないうちに1度一時不停止で捕まり、後1点しかない状態です。
バイクの免許をとってもうそろ１年が経ちます。
今車の教習に通っているのですが、バイクの免許を取って１年経つのでもし車で（車は初心者）違反を起こしてしまった場合は３ヶ月経てば点数は戻りますか？

「後1点しか無い」と言う書き方からして、現在が累積2点で、あと1点取ったら初心者講習になる、と言いたいのだと思いますが、質問者さんの勘違いは…
・違反点数は免許の種類ではなくヒトにつくものだと言う事を理解していない。
・違反点数を数えるシステムが、ヒト単位と免許の種類単位の複数存在することを理解していない。
…からですね。
質問者さんは現在、普通二輪の初心者期間中に普通二輪で違反をして、累積2点、かつ普通二輪の初心者として2点の状態です。取得から1年以内に普通二輪で違反を追加すれば、累積点数が更に増え、かつ普通二輪の初心者講習に呼ばれます。ただし累積6点になるまでは停止の処分はありません。
この状態で普通自動車免許を取得併記しても、普通二輪の初心者期間に変化はなく、普通二輪で違反をすれば前述の通りです。それに加えて、質問者さんは普通自動車の初心者期間にも入り、今後は普通自動車での違反も別に数える事となり、それが3点になったら普通自動車の初心者講習に呼ばれます。
「３ヶ月経てば点数は戻りますか？」
戻りません。累積点数のいわゆる「3か月ルール」は、ヒトにつく累積点数に関するルールで、種類別ではありませんので、新たな種類の免許を追加したかどうかとは関係ありません。また、3か月ルールの適用は「免許歴が2年以上あり、過去2年間が無違反だった」場合のみの適用です。質問者さんが普通自動車免許を取得しても、普通二輪の初取得から数えた免許歴がまだ2年未満のうちは対象外で、累積点数から除外されるには1年間の無違反が必要です。

初心者特例の点数については、免許の種類毎に数えます。
バイクの免許は、その免許でしか運転できないバイクでの違反点数のみを足し算していき、3点以上（1発3点は除く）になると、違反者講習（すっぽかしたり、2回目だと再試験）になる。
途中で4輪免許を取ったとしても、バイクの初心者特例の点数は特にかわらず。
4輪免許の初心者特例は、バイクとは別に数える。
4輪免許の初心者特例も、その4輪免許でしか運転できない乗り物での違反点数のみを足し算していき、3点以上（1発3点は除く）になると処分が発生する。
これとは別に、免停や免取りとかになる点数制度も有り、この点数制度は乗り物の種類に関係無く、全ての点数を足し算していきます。
1年間（条件が揃えば3ヶ月）無事故無違反で過ごすと点数がリセットされると言うのはこちらの点数制度のルールであり、初心者特例は関係有りません。