自分の車はエキマニからリアピースまでの間に純正で2箇所触媒がついています。

自分の車はエキマニからリアピースまでの間に純正で2箇所触媒がついています。
そのパイプ類を全て社外に交換して触媒が1箇所のみになった場合構造変更をして音量と排ガス検査さえ通れば車検に受かるのでしょうか？

車検対応のスポーツキャタライザーにすれば良い。付属排ガス書類は必要。マフラー系も車検対応品なら大丈夫ですが、平成22年4月までの登録車は97dB迄です。年数使うと消音器消耗でどうか？です。又、純正触媒で排ガス検討書作る方は費用がかかりますので2個有るなら元通りが良いかと思いますよ。

年式によっては認定品のマフラーで無いと通らないです
その辺が問題になるでしょうね
１本だけでも試験を受ければ良いような物ですが費用の問題が出てくるでしょう

そのパイプ類を全て社外に交換して触媒が1箇所のみになった場合構造変更をして音量と排ガス検査さえ通れば車検に受かるのでしょうか？
受かると思います