現在大型二種の免許をとりに通っています。第2段階の技能教習で「

現在大型二種の免許をとりに通っています。
第2段階の技能教習で
「大ニセト」
というのがありますが、これは何をするのでしょうか。

恐らくセトはセット教習を表していると思われます。セット教習だとしたら、危険予測のことです。
大型特殊のみ所持や自衛官・元自衛官のような特殊な場合を除いて、普通または準中型免許を持って大型二種を受けているかと思いますが、普通や準中型にもあった「危険予測」の大型二種バージョンです。