大学生です。私は現在、公共交通機関を利用して通学しているのですが、

大学生です。私は現在、公共交通機関を利用して通学しているのですが、車での通学を考えています。家から大学までの距離は車の走行距離で約26kmほどで、毎週月曜から金曜の5日間、通学をしています。この条件の場合
、トヨタ YOYOTAのアクア AQUAか軽自動車どちらが総合的な費用を抑えることができるでしょうか。また、それ以外に費用が抑えられるおすすめの車があれば教えていただきたいです。ちなみに、中古車の購入を考えています。

単純に費用だけみたら軽の方が安いと思います。実燃費大差ないですし、自動車税だけで2万円以上差があるので…。
他の車種だとヤリスHVはアクアより小さいので燃費いいです。みんカラのユーザーレビューだと現行アクアの実燃費は平均22.76km/L、ヤリスは27.09km/Lでした。
私も同じくらいの年齢で、個人的には万が一事故にあった際の安心感や、エアコンの効きなどの点で普通車であるアクアを選びたいなと思いますが、やはり軽の方が全然維持しやすいかと^_^;

まぁ費用を抑えられるのは軽自動車ですね。何年乗る予定かわかりませんが、もしそれなりに年数乗る予定なら普通の中古車より登録済みの未使用中古車を買ってしまう方がメンテナンスなど気を使う部分の負担を減らせるかもしれません。
あとは余談的ですが、休講日などを利用して一度レンタカーとかで実際に運転してみるといいと思います。住んでる地域によりますが、もし都心部なら26kmの距離でも混みや信号で1時間程度以上はかかります。乗り換えが多いとか駅から遠いでもない限り乗っているだけであとは自由な公共交通機関の方が楽と感じる場合もあると思いますよ。

アクアも軽も持っていますが、
総合的な費用となると軽が圧倒的に安いです。
軽でも15〜22km/L走ります。
友達乗せて出かけないなら
4ナンバーの自家用車軽貨物が最安値です。

通学以外に日時の足で往復５０Ｋｍ程度の利用なら軽自動車。
既に指摘が有るけど毎年の自動車税だけで３倍は違う。
卒業までの予定なら尚更ですね。
定期収入を得る身分になれば年収に応じた範囲のローンで好きな車に乗れますよ。

スズキ アルト
実燃費ならアルトより走ります。
価格も安いです。
中古車市場でもそこまで値上がりしていないと思います。

車 維持費 年間 で検索すれば、概算できるサイトはワンサカあります。大学生なのですから、安易に聞く前に自分で調べてみる。という癖は付けるべきです。それは社会に出ても同じことなので今から、身につけましょう。