ワゴン WagonRを新車購入したのですが乗り降りのとき半ドアになりやす

ワゴン WagonRを新車購入したのですが乗り降りのとき半ドアになりやすいです。
乗り降りの時に強めにドアを閉めないと、必ず半ドアになります。
これはディーラーで調整してもらえば改善されますか？
それとも自然に直っていきますか？

たぶん車内の空気が抜け難い為、半ドアになり易いのだと思います！
どの窓でも良いですが、窓をほんの僅かに下げると解消するかもしれませんからやってみて下さい

これはディーラーで調整してもらえば改善されますか？

治ると

ドアストライカー関係・調整
ドアのウエザーストリップが新品なので弾力が硬い

気密性が良いことが原因なので、ウェザーストリップやパッキンが痛んでいけば、半ドアになりづらくなっていくでしょう。それを「改善」と呼ぶかどうかは微妙ですが。
ドアバイザーを付けているなら、どこかの窓をごく細く開けておくというのも手です。

自然には直らない。
閉まらないからと強めでバンバン閉めてるとキャッチ壊すよ。