トヨタプリウス PRIUSαとホンダ Hondaフィット FITシャトルならば、プリウス PRIUSの方が乗りごご

トヨタ YOYOTA プリウス PRIUSαとホンダ Honda フィット FITシャトルならば、プリウス PRIUSの方が乗りごごちが良いでしょうか？

車の乗り心地は数値などで表せませんので、感覚的な物になります。
同じ車でも人によって評価も違います。
現在のっている車などの影響もあり、好き嫌いもあります。
人によれば硬めの好きな人や柔らかめの好きな人も居ます。
短時間で有れば柔らかめの方が乗り心地が良いと思う人が多いでですが、長時間乗り続けるに硬い目の方が良いかもしれませんので、短時間の乗り比べで判断するのも危険です。
それでも、お比べの車なら一般的にはプリウスαの方が高価ですが大きく重くて、タイヤやシートなども違いますし重厚で一般的には良い乗り心地と言えると思います。

そのレベルの比較なら、車種よりも、ただ高い値段を付けるため不相応にでかいホイールを付けたグレードを選ばないことです。

乗り心地とはどんなものを求めていらっしゃるのか分かりませんが、数キロ離れたスーパーに買い物に行くのがメインなら柔らかいサスやシートが良いし、高速や山道をを使い長時間乗る事が多いのならしっかりしたサスとタイヤが付いていた方が良いし。
あなたの使い方で比べてみないと一概に車種で比較するのは難しいですね。一般的なことではホイールベースがフィットで2500mmに対し、プリウスは2780mmで先代マークⅡと同じですから比較対象外でしょう。

ハイブリッド技術はどちらもひけをとらないのですが足回りはどちらもコストダウンの影響でどちらが良いと言い切れません。なので判断するのは質問者さん自身です。どちらも甲乙付け難いので。