トヨタの純正ナビを使っているんですけど新しいナビの情報を更新できるようにした

トヨタ YOYOTAの純正ナビを使っているんですけど
新しいナビの情報を更新できるようにしたいとき
オートバックスなどでも施工してもらえるのでしょうか？

純正ナビならディーラーでやってください。

オートバックスでやってもらうにはトヨタからSDカードを取り寄せて更新作業をしてもらいます。
たぶんディーラーでやるより割高になると思います。
なおHDナビでしたらディーラーでしか出来ません。

ディーラーに行かないとできません。

まぁやってはくれると思いますが 普通にトヨタでやる方が早くて安いと思いますよ
ＳＤタイプなら 適合調べて通販で買えば安いです