オデッセイ ODYSSEYの新車の見積もりを違う系列の店舗でだしてもらいました。OSS申請

オデッセイ ODYSSEYの新車の見積もりを違う系列の店舗でだしてもらいました。
OSS申請代行費用が9000円以上違いがありました。この差はなんでしょうか？
また、下取車査定料が約6000円発生していました。これは省けれますか？

代行費用の金額は販社ごとで決めることが出来ます
これは陸運局までの距離や事業所の規模（人件費等）、事情によりさまざまです
一般的には同じ地域のディーラーは同じような金額に設定するのが普通なのですが、強制ではありませんしね
下取査定料は省くことが出来る販社と下取りがある以上は省く事の出来ない販社があります
省けないところでは値引きで調整してもらうしかないですね
いずれにしても各販売店の事情により料金設定されていますので違いはあるものです

法定費用を除く登録関係の手数料は各ディーラーなどで自由に設定できるので、違いはあります。
登録自体もディーラーの担当者が行う事もあれば、行政書士や外部団体などへ依頼する場合もあるので余計に差が出ます。
下取車があれば通常は査定料は発生します。
カットしてくれるかは交渉次第です。