自動車の運転免許を息子がとりにいくのですが原付免許は別に取らなければいけ

自動車の運転免許を息子がとりにいくのですが原付免許は別に取らなければいけないのでしょうか

いいえ。
普通免許を取得すると、
普通自動車・小型特殊自動車・原動機付自転車を
運転することができます。

敢えて答えませんが、免許を取るのですから、ちゃんと「取る条件」を調べて下さい。