大型、中型とかバイク等の免許を持っている人が普通車を運転してて、免許取

大型、中型とかバイク等の免許を持っている人が普通車を運転してて、免許取り消しの違反をしました…‥この場合、全ての免許証が取り消しになるにょ？

そういうことです。免許全部取り消しになります。道路交通法は同じですので。

その通りですにょ。
ちなみに理由としては、「そういう(違反)行為をするような"運転者"を道路に出さないため」に取り消し等の制度があるとのこと。つまり、「そもそも違反をするようなヤツはヤバいヤツだから、どんな車であっても運転させない」ということなのでしょう。

そうですよ。
大型二種免許を持っている人が、原付に乗って違反して取り消しになる事も十分有り得ます。

その通りです。すべての免許が取り消しになります。そもそも免許を所持する資格が無くなったと言うことです。