企業は税金（固定資産税や法人税など）を払っています。それら税金は企業

企業は税金（固定資産税や法人税など）を払っています。それら税金は企業が販売するモノの価格に転嫁（生産費・原価）されて、消費者はその製品を買うと消費税を払う。
消費者からにるとに二重課税になりませんか？

企業が赤字で法人税払ってない場合は二重課税ではなく
企業が黒字だと二重課税ってことですか？
企業の次の決算まで今年は赤字か黒字か、法人税がいくらか決まらないのに
どうやって判断するのでしょうか

なりませんよ 法人税は利益にかかる税金で 利益が出なければ支払いません。固定資産は資産に掛かる税金です。
消費税とは消費に掛かる税金であり 買うものに掛かる税ではありません。
土地は買っても 消費する訳では無いので 土地を買っても消費税は支払いません。

消費者は法人税を支払っていないので二重課税とは言いません。法人税が価格に転嫁されているかどうかは、検証のしようがありません。
そもそも二重課税の例は多数あり珍しいものではありません。